Le périmètre Natura 2000
A l'origine, le périmètre s'étendait sur 72 ha et concernait seulement deux sites en Arrêté Préférectoral de Protection de Biotope (APPB) : Marais du Pont-Neuf et Moyenne Vallé de l'Arve.
Trop restreint et trop morcellé, il ne permettait pas une gestion vaste échelle des espèces et les habitats remarquable qui ont été visés par la politique Natura 2000.
Le comité de pilotage et les communes concernées ont oeuvré pour étendre le site à tous les espaces naturels situés entre la confluence avec le Giffre et la frontière Suisse. La surface du site a ainsi été portée à 760 ha et le site est aujourd'hui désigné à la fois au titre de la Directive "Habitats" et la Directive "Oiseaux". Un troisième APPB est venu se rajouter : Bois de Vernaz et Iles d'Arve, près de la frontière Suisse.
Le périmètre s'étend donc sur 15 communes le long de la rivière Arve d'amont en Aval:
Thyez, Vougy, Marignier, Saint-Pierre-en-Faucigny, Bonneville, Arenthon, Scientrier, Contamine sur Arve, Nangy, Reignier, Arthaz-Pont-Notre-Dame, Monnetier-Mornex, Vetraz-Monthoux, Etrembières, Gaillard.